Сравнение минимального графа перекрытий с другими структурами

Published: 17 June 2025| Version 1 | DOI: 10.17632/27y9yy5bnz.1
Contributor:
Evgenia Furletova

Description

Для наборов мотивов из баз данных HOCOMOCO и PROSITE построены минимальный граф перекрытий, граф перекрытий, автомат Ахо-Корасик, а также минимальный граф Ахо-Корасик. Проведено сравнение размеров построенных структур. А также с помощью программ SufPref и MinSufPref вычислены p-значения обнаружения отобранных мотивов в случайной последовательности.

Files

Categories

Bioinformatics

Licence