Tutorial for quantification of collective signalling in time-lapse microscopy images
Published: 15 March 2024| Version 1 | DOI: 10.17632/z29fyn6kzz.1
Contributor:
Maciej DobrzynskiDescription
Raw data and a Jupyter notebook with Python code to quantify apoptosis-induced collective ERK activity waves in a starved MCF10A WT epithelium.
Files
Steps to reproduce
Download all folders, open the Jupyter notebook file "scripts/arcos-tutorial.ipynb", run the notebook.
Institutions
Universitat Bern
Categories
Cell Biology, Clustering, Mitogen-Activated Protein Kinase, Fluorescence Microscopy, Spatial Analysis, Time Series, Computational Biology
Funding
Chan Zuckerberg Initiative
2022-252527
Human Frontier Science Program
RGP0043/2019
Krebsliga Schweiz
KLS-4867-08-2019
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
31003A-163061
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
51PHPO-163583
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
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